Tóm tắt: Cửa sông Thu Bồn (QN) là dạng cửa sông đóng mở theo mùa và di động theo chu kỳ dưới tác động tổng hợp của các điều kiện sông biển. Phần mềm MIKE 21 FM được ứng dụng để mô phỏng trường sóng, dòng chảy và bùn cát với điều kiện thủy vải văn đặc trưng. Kết quả cho thấy vào thời kỳ gió mùa đông bắc vận chuyển bùn cát tổng cộng có hướng từ Bắc xuống Nam với xu thế xói bồi xen kẽ và bùn cát được mang tới khu vực trước cửa sông với tổng lượng khoảng 60.000 - 70.000 m³/năm và thời kỳ gió mùa Tây Nam tình hình ngược lại với vận chuyển bùn cát từ phía Nam lên lớn hơn từ phía Bắc xuống với tổng lượng khoảng 40.000 m³/năm, nhưng có hiện tượng xói mùa hè và bồi mùa đông. Khu vực trước cửa sông có xu thế được bồi tạo thành các bar cát ngầm chắn ngang cửa. Diễn biến trên làm cho cửa sông có xu thế di động, nhưng xu thế hầu hết các tháng trong năm trừ tháng mùa lũ. Dựa trên kết quả mô phỏng, hệ thống côn trình gồm 2 Jetty được thiết kế với nhiệm vụ chắn cát, chống bồi, đảm bảo thoát lũ và tạo luồng vận tải thủy.